Исследование полного сбора генома от теломеры к теломере открывает новые возможности разработки сельскохозяйственных культур, которые обладают высокой устойчивостью к засухе, засолению и вредителям.
Международное исследование «Освещение генетики растений с использованием полных сборок генома от теломеры к теломере» было проведено учеными из Центра инноваций в области растениеводства и продовольствия (CCFI) при Университете Мердока.
Благодаря полным сборкам теломера-теломера (T2T), ученым удалось сопоставить всю структуру генома, что является фундаментом для молекулярного отбора с целью улучшить производительность растений в различных стрессовых условиях.
Профессор Раджив Варшни, руководитель исследования и директор CCFI, заявил, что анализ генома является краеугольным камнем генетических исследований.
«Сборка генома подобна сборке пазла, когда каждая часть генома собирается аккуратно. Полные сборки генома T2T образуют целостную и непрерывную картину генома. Наша задача - убедиться, что тысячи генов в геноме собраны в правильном порядке по всей хромосоме и что они гармонично сочетаются между собой», - сказал профессор Варшни.
Доктор Ваника Гарг, автор первой научной работы и исследователь CCFI, отметила, что достигнутый уровень точности в секвенировании генов привел к настоящему прорыву.
«Ранее сборка генома T2T была невозможна из-за неточного секвенирования генов, что могло привести к ошибкам, включая неверные аннотации. Это означало, что гены, отвечающие за желаемые характеристики, были пропущены. Однако благодаря прогрессу в технологиях секвенирования, мы наконец-то можем получить полные сборки генома T2T для любых сельскохозяйственных культур», - сказала доктор Гарг.
В настоящее время профессор Варшни и его исследовательская группа сотрудничают с несколькими лабораториями из Австралии, Великобритании, Германии, США и Китая в разработке полных сборок генома T2T или почти полных сборок генома для нескольких культур, таких как пшеница, нут, конские бобы, папайя, маракуйя, сметанное яблоко (аннона колючая, ценнейший тропический плод), банан и ананас.
«Вместе с нашими коллегами из разных стран мы применяем методы сборки генома T2T к нескольким сельскохозяйственным культурам и рады видеть, как это способствует развитию сельскохозяйственных исследований в Австралии и за рубежом. Сборки генома T2T позволяют получить доступ к ранее недоступным участкам генома и открывают новые возможности для исследований, такие как создание новых сортов сельскохозяйственных культур, которые отвечают нашим будущим потребностям», - заключил профессор Варшни.
